Pithecanthropus erectus fosilijų atradimas Trinile, Rytų Java 1891 m. Buvo vienas iš svarbiausių išradimų Indonezijos biologinėje istorijoje.
Šeštajame dešimtmetyje botanikas, vardu Soejatmi TjitroSomo, sugebėjo rasti naują augalų rūšį, kuri vėliau buvo pavadinta Nepenthes Djamban.
1961 m. Biologui, vardu Soedjito Soemodihardjo, sugebėjo rasti naują žuvų rūšį Toboje, kuri vėliau buvo pavadinta Toba.
1978 m. Biologinės įvairovės tyrime Lorentz nacionaliniame parke, Papua, pavyko rasti naują paukščių rūšį, vardu Cicinnurus Lorentzi.
1981 m. Jūrų biologui, vardu Yulius Purwanto, Lombokų vandenyse pavyko rasti naują žuvų rūšį, kuri vėliau buvo pavadinta Pseudanthias Lombokensis.
1993 m. Biologui, vardu Djaja Doel Soejarto, pavyko rasti naujų cheminių junginių iš augalų, kurie vėliau buvo naudojami kaip vaistiniai ingredientai vėžiui gydyti.
2001 m. Jūrų biologui, vardu Jamaluddin Jompa, Wakatobi vandenyse, Pietryčių Sulavezyje, pavyko rasti naują koralinių rifų rūšis.
2006 m. Molekuliniam biologui, vardu Herawati Sudoyo, pavyko rasti genetinius pokyčius žmonėms Indonezijoje, kurie skiriasi nuo žmogaus genetikos už Indonezijos ribų.
2010 m. Biologinės įvairovės tyrime Gunung Leuser nacionaliniame parke Sumatroje pavyko rasti naują paukščių rūšį, vardu Zoothera Salimalii.
2015 m. Jūrų biologui, vardu Fitry Pakiding, Bunaken, Šiaurės Sulavezio vandenyse, pavyko rasti naują medūzų rūšį, kuri vėliau buvo pavadinta Eufysa Bunakenensis.
