Oppdagelsen av Pithecanthropus erectus fossiler i Trinil, Øst -Java i 1891 var en av de viktigste oppfinnelsene i biologisk historie i Indonesia.
På 1930 -tallet klarte en botaniker ved navn Soejatmi Tjitrosomo å finne en ny planteart som senere ble kalt Nepenthes Djamban.
I 1961 klarte en biolog ved navn Soedjito Soemodihardjo å finne en ny fiskeart i Toba -sjøen som senere ble kalt Toba.
I 1978 klarte en studie av biologisk mangfold i Lorentz nasjonalpark, Papua, å finne en ny fugleart ved navn Cicinnurus Lorentzi.
I 1981 klarte en marinbiolog ved navn Yulius Purwanto å finne en ny fiskeart i Lombok Waters som senere ble kalt Pseudanthias Lombokensis.
I 1993 klarte en biolog ved navn Djaja Doel Soejarto å finne nye kjemiske forbindelser fra planter som deretter ble brukt som medisinske ingredienser for å behandle kreft.
I 2001 klarte en sjøbiolog ved navn Jamaluddin Jompa å finne en ny korallrevart i Wakatobi Waters, Sørøst -Sulawesi.
I 2006 klarte en molekylærbiolog ved navn Herawati Sudoyo å finne genetiske variasjoner hos mennesker i Indonesia som er forskjellige fra menneskelig genetikk utenfor Indonesia.
I 2010 klarte en studie av biologisk mangfold i Gunung Leuser nasjonalpark, Sumatra, å finne en ny fugleart ved navn Zoothera Salimalii.
I 2015 klarte en marinbiolog ved navn Fitry Pakiding å finne en ny maneterart i vannet i Bunaken, North Sulawesi som senere ble kalt Euphysa Bunakenensis.
