İndoneziya, köpək balığı və məşhur şüalar da daxil olmaqla 3000-dən çox növ balıq, o cümlədən evdədir.
Raja Ampat adaları West Papua-da 1500-dən çox növ balıq və 600 mərcan növü var.
İndoneziyanın mərcan qayaları Avstraliyadakı böyük maneə qayasından sonra dünyada ikinci ən böyükdür.
Qorunan yaşıl dəniz tısbağaları İndoneziya sularında yaşayır və 1 metrə qədər böyüyə bilər.
İndoneziya sularında tapıla bilən 20-dən çox delfin və balinalar var.
İndoneziyanın mərcan qayaları hər il ən azı 15 milyon ton balıq istehsal edir.
Nemo tapmaq filmindəki əsas personaj olan təlxək balıq, doğma İndoneziya balığı növüdir.
İndoneziya suları da böyük və gözəl Manta Ray ilə məşhurdur.
İndoneziya sularında tapıla bilən 70-dən çox növ meduza növü var.
İndoneziyada dünyanın ən yaxşı dalğıc yerləri, o cümlədən Şimali Sulawesi və Şərqi Nusa Tenggara'nın Komodo Milli Parkında Bunaken Milli Parkı da daxil olmaqla dünyanın ən yaxşı dalğıc yerləri var.
