Индонезия е дом на повече от 3000 вида риби, включително акули и известни лъчи.
Раджа Ампат острови в Западна Папуа имат повече от 1500 вида риби и 600 вида корали.
Кораловите рифове на Индонезия са вторият по големина в света след Големия бариерен риф в Австралия.
Защитените зелени морски костенурки живеят в индонезийски води и могат да растат до 1 метър.
Има повече от 20 вида делфини и китове, които могат да бъдат намерени в индонезийските води.
Индонезийските коралови рифове произвеждат най -малко 15 милиона тона риба всяка година.
Клоунската риба, която е главният герой във филма Намиране на Немо, е вид местна индонезийска риба.
Индонезийските води са известни и със своите велики и красиви Манта Рей.
Има повече от 70 вида медузи, които могат да бъдат намерени в индонезийските води.
Индонезия има едни от най -добрите места за гмуркане в света, включително Националния парк Бунакен в Северен Сулавеси и Националния парк Комодо в Източна Нуса Тенгара.