Indonezja jest domem dla ponad 3000 gatunków ryb, w tym rekinów i słynnych promieni.
Wyspy Raja Ampat w Zachodniej Papua mają ponad 1500 gatunków ryb i 600 gatunków koralowych.
Rafy koralowe w Indonezji są drugim co do wielkości na świecie po Wielkiej Rafie Koralowej w Australii.
Chronione zielone żółwie morskie żyją w wodach indonezyjskich i mogą dorastać do 1 metra.
Istnieje ponad 20 rodzajów delfinów i wielorybów, które można znaleźć w wodach indonezyjskich.
Rafy koralowe w Indonezji produkują co najmniej 15 milionów ton ryb rocznie.
Ryba klauna, która jest główną postacią w filmie Finding Nemo, jest gatunkiem rodzimych ryb indonezyjskich.
Wody indonezyjskie są również znane z wspaniałej i pięknej Manta Ray.
Istnieje ponad 70 rodzajów meduz, które można znaleźć w wodach indonezyjskich.
Indonezja ma jedne z najlepszych lokalizacji nurkowania na świecie, w tym Park Narodowy Bunaken w North Sulawesi i Komodo National Park we wschodniej Nusa Tenggara.
