Indonesia là nơi sinh sống của hơn 3.000 loài cá, bao gồm cá mập và tia nổi tiếng.
Quần đảo Raja Ampat ở Tây Papua có hơn 1.500 loài cá và 600 loài san hô.
Các rạn san hô của Indonesia là lớn thứ hai trên thế giới sau rạn san hô Great Barrier ở Úc.
Rùa biển xanh được bảo vệ sống ở vùng biển Indonesia và có thể phát triển lên tới 1 mét.
Có hơn 20 loại cá heo và cá voi có thể tìm thấy ở vùng biển Indonesia.
Các rạn san hô của Indonesia sản xuất ít nhất 15 triệu tấn cá mỗi năm.
Cá chú hề, là nhân vật chính trong phim tìm thấy Nemo, là một loài cá bản địa Indonesia.
Vùng nước Indonesia cũng nổi tiếng với Manta Ray tuyệt vời và tuyệt đẹp.
Có hơn 70 loại sứa có thể được tìm thấy ở vùng biển Indonesia.
Indonesia có một số địa điểm lặn tốt nhất trên thế giới, bao gồm Công viên Quốc gia Bunaken ở Công viên Quốc gia Bắc Sulawesi và Komodo ở Đông Nusa Tenggara.
