इंडोनेशिया मछली की 3,000 से अधिक प्रजातियों का घर है, जिसमें शार्क और प्रसिद्ध किरणें शामिल हैं।
पश्चिम पापुआ में राजा अम्पाट द्वीपों में मछली की 1,500 से अधिक प्रजातियां और 600 मूंगा प्रजातियां हैं।
ऑस्ट्रेलिया में ग्रेट बैरियर रीफ के बाद इंडोनेशिया के कोरल रीफ्स दुनिया में दूसरे सबसे बड़े हैं।
संरक्षित हरे समुद्री कछुए इंडोनेशियाई पानी में रहते हैं और 1 मीटर तक बढ़ सकते हैं।
20 से अधिक प्रकार के डॉल्फ़िन और व्हेल हैं जो इंडोनेशियाई पानी में पाए जा सकते हैं।
इंडोनेशिया के कोरल रीफ्स हर साल कम से कम 15 मिलियन टन मछली का उत्पादन करते हैं।
क्लाउन फिश, जो फिल्म फाइंडिंग निमो में मुख्य चरित्र है, देशी इंडोनेशियाई मछली की एक प्रजाति है।
इंडोनेशियाई वाटर्स भी अपने महान और सुंदर मंटा रे के लिए प्रसिद्ध हैं।
70 से अधिक प्रकार के जेलिफ़िश हैं जो इंडोनेशियाई पानी में पाए जा सकते हैं।
इंडोनेशिया के पास दुनिया के कुछ सबसे अच्छे डाइविंग स्थान हैं, जिनमें उत्तर सुलावेसी में बनकेन नेशनल पार्क और पूर्वी नुसा तेंगारा में कोमोडो नेशनल पार्क शामिल हैं।
