Indonezija je več kot 3000 vrst rib, vključno z morskimi psi in znanimi žarki.
Otoki Raja Ampat v Zahodni Papui imajo več kot 1500 vrst rib in 600 koralnih vrst.
Indonezijski koralni grebeni so drugi največji na svetu po Velikem pregradnem grebenu v Avstraliji.
Zavarovane želve zelene morje živijo v indonezijskih vodah in lahko zrastejo do 1 metra.
V indonezijskih vodah je mogoče najti več kot 20 vrst delfinov in kitov.
Indonezijski koralni grebeni vsako leto proizvajajo vsaj 15 milijonov ton rib.
Klovnske ribe, ki je glavni lik v filmu Finding Nemo, je vrsta domačih indonezijskih rib.
Indonezijske vode so znane tudi po svojem odličnem in čudovitem manto Rayu.
Obstaja več kot 70 vrst meduz, ki jih lahko najdemo v indonezijskih vodah.
Indonezija ima nekaj najboljših potapljaških lokacij na svetu, vključno z nacionalnim parkom Bunaken v Severnem Sulawesiju in nacionalnim parkom Komodo v vzhodni Nusa Tenggara.
