Na década de 1950, a Indonésia foi um dos países que sofreram mais malária no mundo.
Antes do colonialismo holandês, a medicina tradicional usando ingredientes à base de plantas e práticas médicas alternativas, como reflexologia e massagem de vidraça.
Durante o auge do Reino Majapahit, havia um sistema de saúde bem organizado, incluindo sistemas de saneamento e tratamento.
Durante o período colonial japonês, houve um aumento nos serviços de saúde, como programas de vacinação e construção hospitalar.
Na década de 1960, a Indonésia experimentou uma epidemia de gripes de aves mortais.
Na década de 1980, a Indonésia tornou -se um dos países com uma alta incidência de HIV/AIDS.
Nos anos 90, a Indonésia experimentou uma epidemia de cólera que matou muitas vidas.
Nos anos 2000, a Indonésia tornou -se um dos países com uma alta incidência de nanismo (falhou em crescer) em crianças.
Nos anos 2010, a Indonésia experimentou a epidemia do vírus Corona pela primeira vez com o surgimento do caso MERS-CoV.
Atualmente, a Indonésia está intensamente vacinada para superar o Pandemi CoVid-19.