Микроорганизмите могат да се намерят навсякъде, вариращи от почва до въздух и дори в човешкото тяло и животните.
Бактериите са най -често срещаните микроорганизми, открити в природата, включително в Индонезия.
Едно от известните микробиологични изследвания от Индонезия е откриването на бактерии, произвеждащи стрептомицин, произвеждащи бактерии от проф. Д -р Джоко Соеджарто през 1943 г.
Микроорганизмите имат важна роля в естествения хранителен цикъл, като разлагане на органичната материя в хранителни вещества за растенията.
Някои видове микроорганизми могат да се използват за производство на храни и напитки, като кисело мляко, кефир и темпера.
Индонезия има високо биоразнообразие, толкова много уникални микроорганизми могат да бъдат намерени там.
Микроорганизмите играят важна роля в индустриалното производство, като производството на био гориво и химикали.
Качеството на водата в Индонезия може да бъде повлияно от съществуването на микроорганизми, като колиформени бактерии, които могат да показват лошо качество на водата.
Микроорганизмите също имат важна роля в медицинската област, като например в развитието на ваксини и лекарства.
Индонезия има няколко добре познати лаборатории за микробиология, като лабораторията по микробиология на Медицинския факултет, Университета на Индонезия и Центъра за лаборатория по микробиология за ветеринарни изследвания.
