Mikroorganizmy možno nájsť kdekoľvek, od pôdy po vzduch a dokonca aj v ľudskom tele a zvieratách.
Baktérie sú najbežnejšími mikroorganizmami nachádzajúcimi sa v prírode, a to aj v Indonézii.
Jednou zo známych mikrobiologických štúdií z Indonézie je objav baktérií produkujúcich streptomycínom produkujúce prof. DR. Djoko Soejarto v roku 1943.
Mikroorganizmy majú dôležitú úlohu v prírodnom výživovom cykle, ako je napríklad rozklad organických látok do živín pre rastliny.
Niektoré druhy mikroorganizmov sa môžu použiť na výrobu jedla a nápojov, ako sú jogurt, kefír a tempeh.
Indonézia má vysokú biodiverzitu, takže tam nájdete veľa jedinečných mikroorganizmov.
Mikroorganizmy zohrávajú dôležitú úlohu pri priemyselnej výrobe, ako je výroba bio paliva a chemikálie.
Kvalita vody v Indonézii môže byť ovplyvnená existenciou mikroorganizmov, ako sú koliformné baktérie, ktoré môžu naznačovať zlú kvalitu vody.
Mikroorganizmy majú tiež dôležitú úlohu v oblasti medicíny, napríklad pri vývoji vakcín a liekov.
Indonézia má niekoľko známych mikrobiologických laboratórií, ako napríklad mikrobiologické laboratórium Lekárskej fakulty, Indonézia University a Mikrobiologické laboratórne centrum pre veterinárne výskumné centrum.