Mikroorganizmus galima rasti bet kur, pradedant nuo dirvožemio iki oro ir net žmogaus kūne bei gyvūnuose.
Bakterijos yra labiausiai paplitę gamtoje esantys mikroorganizmai, įskaitant Indonezijoje.
Vienas iš garsiųjų Indonezijos mikrobiologinių tyrimų yra prof. Streptomicino antibiotikų gamybos bakterijų atradimas. Dr. Djoko Soejarto 1943 m.
Mikroorganizmai vaidina svarbų vaidmenį natūraliame mitybos cikle, pavyzdžiui, organinių medžiagų skilimas augaluose.
Kai kurios mikroorganizmų rūšys gali būti naudojamos maistui ir gėrimams, tokiems kaip jogurtas, kefyras ir tempeh, gaminti.
Indonezija turi aukštą biologinę įvairovę, todėl ten galima rasti daug unikalių mikroorganizmų.
Mikroorganizmai vaidina svarbų vaidmenį pramoninėje gamyboje, pavyzdžiui, biologiniu degalų gamyba ir chemikalai.
Vandens kokybei Indonezijoje gali turėti įtakos mikroorganizmų, tokių kaip koliforminės bakterijos, egzistavimas, kuris gali reikšti prastą vandens kokybę.
Mikroorganizmai taip pat vaidina svarbų vaidmenį medicinos srityje, pavyzdžiui, kuriant vakcinas ir narkotikus.
Indonezija turi keletą gerai žinomų mikrobiologijos laboratorijų, tokių kaip Medicinos fakulteto mikrobiologijos laboratorija, Indonezijos universitetas ir Veterinarijos tyrimų centro Mikrobiologijos laboratorijos centras.
