Tuổi trung niên ở Indonesia bắt đầu từ thế kỷ thứ 8 đến 16, đặc biệt là ở các khu vực của Java và Sumatra.
Vương quốc Hindu-Buddhist, như Vương quốc Srivijaya và Vương quốc Majapahit, đã trở thành trung tâm của văn hóa và thương mại trong quần đảo vào thời điểm này.
Thời trung cổ của Indonesia còn được gọi là Thời đại hoàng kim của Nghệ thuật và Kiến trúc, chẳng hạn như Đền Borobudur và Prambanan.
Vào thế kỷ 13, Marco Polo, một nhà thám hiểm từ Ý, đã đến thăm các cảng trong quần đảo và ghi lại về cuộc sống ở đó.
Vào thế kỷ 14, một thủy thủ Hồi giáo từ Ma -rốc tên là Ibn Battuta cũng đã đến thăm Indonesia và viết về kinh nghiệm của mình ở đó.
Sultan Agung từ Mataram trở thành một trong những nhân vật quan trọng vào thời điểm này vì nó đã thành công trong việc hợp nhất lãnh thổ Java và xây dựng một vương quốc mạnh mẽ.
Vào cuối thế kỷ 16, người Bồ Đào Nha bắt đầu kiểm soát việc buôn bán gia vị ở quần đảo và các pháo đài được xây dựng ở các khu vực ven biển.
Vào thế kỷ 17, VOC (Vereenigde Oost-Indische Compagnie) đã trở thành lực lượng thống trị trong quần đảo và kiểm soát việc buôn bán gia vị.
Vào đầu thế kỷ 19, Indonesia bắt đầu trở thành trung tâm của cuộc đấu tranh giành độc lập từ chủ nghĩa thực dân Hà Lan.
Năm 1945, Indonesia đã thành công trong việc tuyên bố độc lập và trở thành một quốc gia độc lập.