Vědecké vzdělávání v Indonésii začalo v nizozemském koloniálním období v 19. století.
V roce 2021 byla Indonésie zahrnuta do pěti nejlepších zemí s nejvyšším počtem vědeckých publikací v jihovýchodní Asii.
V roce 2020 se Indonésie umístila na 62. místě na světě, pokud jde o kvalitu přírodovědného vzdělávání podle žebříčku QS World University.
Jedním z populárních programů vědeckého vzdělávání v Indonésii je Olympiáda National Science (OSN), která se každý rok koná pro studenty středních škol.
Indonésie má také několik známých univerzit, které nabízejí vědecké studijní programy, jako je Bandung Institute of Technology (ITB) a Gadjah Mada University (UGM).
Od roku 2013 přijala Indonésie kurikulum 2013, které zdůrazňuje interaktivnější a aplikační učení.
Indonésie je také aktivní ve výzkumu a vývoji vědy, zejména v zemědělství, informačních technologiích a obnovitelné energii.
Vědecké vzdělávání v Indonésii zahrnuje také lekce o životním prostředí a zachování přírody.
Indonésie má několik zajímavých vědeckých muzeí, jako je muzeum Bandung Geology Museum a Bogor Zoolology Museum.
Některé slavné vědy z Indonésie zahrnují Prof. Dr. Bambang Purwanto, fyzik a kancléř univerzity Gadjah Mada, a Prof. Dr. Sri Sultan Hamengkubuwono X, biolog a guvernér DIY.