Giáo dục khoa học ở Indonesia bắt đầu trong thời kỳ thuộc địa Hà Lan vào thế kỷ 19.
Năm 2021, Indonesia được đưa vào năm quốc gia hàng đầu với số lượng ấn phẩm khoa học cao nhất ở Đông Nam Á.
Năm 2020, Indonesia xếp thứ 62 trên thế giới về chất lượng giáo dục khoa học theo bảng xếp hạng của Đại học Thế giới QS.
Một trong những chương trình giáo dục khoa học phổ biến ở Indonesia là Olympic khoa học quốc gia (OSN), được tổ chức hàng năm cho học sinh trung học.
Indonesia cũng có một số trường đại học nổi tiếng cung cấp các chương trình nghiên cứu khoa học, chẳng hạn như Viện Công nghệ Bandung (ITB) và Đại học Gadjah Mada (UGM).
Kể từ năm 2013, Indonesia đã áp dụng chương trình giảng dạy năm 2013, trong đó nhấn mạnh việc học tập tương tác và ứng dụng nhiều hơn.
Indonesia cũng tích cực trong nghiên cứu và phát triển khoa học, đặc biệt là trong nông nghiệp, công nghệ thông tin và năng lượng tái tạo.
Giáo dục khoa học ở Indonesia cũng bao gồm các bài học về môi trường và bảo tồn thiên nhiên.
Indonesia có một số bảo tàng khoa học thú vị, như Bảo tàng Địa chất Bandung và Bảo tàng Zoolology Bogor.
Một số nhân vật khoa học nổi tiếng từ Indonesia bao gồm Giáo sư. Chất cấp. Bambang Purwanto, một nhà vật lý và thủ tướng của Đại học Gadjah Mada, và Giáo sư. Chất cấp. Sri Sultan Hamengkubuwono X, một nhà sinh vật học và thống đốc của DIY.
