Videnskabsuddannelse i Indonesien begyndte i den hollandske kolonitid i det 19. århundrede.
I 2021 blev Indonesien inkluderet i de fem bedste lande med det højeste antal videnskabelige publikationer i Sydøstasien.
I 2020 rangerede Indonesien 62. i verden med hensyn til kvaliteten af videnskabsuddannelse ifølge QS World University Rankings.
Et af de populære videnskabelige uddannelsesprogrammer i Indonesien er National Science Olympiad (OSN), der afholdes hvert år for gymnasiestuderende.
Indonesien har også flere velkendte universiteter, der tilbyder videnskabsundersøgelsesprogrammer, såsom Bandung Institute of Technology (ITB) og Gadjah Mada University (UGM).
Siden 2013 har Indonesien vedtaget 2013 -læseplanen, der understreger mere interaktiv og anvendelse.
Indonesien er også aktiv inden for forskning og udvikling af videnskab, især inden for landbrug, informationsteknologi og vedvarende energi.
Videnskabsuddannelse i Indonesien inkluderer også lektioner om miljø og bevarelse af naturen.
Indonesien har adskillige interessante videnskabsmuseer, såsom Bandung Geology Museum og Bogor Zoologology Museum.
Nogle berømte videnskabsfigurer fra Indonesien inkluderer prof. Dr. Bambang Purwanto, en fysiker og kansler ved Gadjah Mada University, og prof. Dr. Sri Sultan Hamengkubuwono X, en biolog og guvernør i DIY.
