Teadusharidus Indoneesias sai alguse Hollandi koloniaalperioodil 19. sajandil.
Aastal 2021 kaasati Indoneesia viies parimasse riiki, kus Kagu -Aasia teadusväljaannete arv oli kõige rohkem.
2020. aastal oli Indoneesia QS World University edetabeli kohaselt maailmas 62. koha maailmas teadushariduse kvaliteedi osas.
Üks Indoneesia populaarse teaduse haridusprogramme on riiklik teaduse olümpiaad (OSN), mis toimub igal aastal keskkooliõpilastele.
Indoneesias on ka mitu hästi tuntud ülikoole, mis pakuvad teaduse õppeprogramme, näiteks Bandungi tehnoloogiainstituut (ITB) ja Gadjah Mada ülikool (UGM).
Alates 2013. aastast on Indoneesia võtnud vastu 2013. aasta õppekava, mis rõhutab interaktiivsemat ja rakendavat õppimist.
Indoneesia on aktiivne ka teaduse uurimisel ja arendamisel, eriti põllumajanduses, infotehnoloogias ja taastuvenergias.
Teadusharidus Indoneesias hõlmab ka õppetunde keskkonna ja looduse säilitamise kohta.
Indoneesias on mitu huvitavat teadusmuuseumi, näiteks Bandungi geoloogiamuuseum ja Bogori zoololoogiamuuseum.
Mõnede kuulsate teadusarjade hulka kuuluvad prof. Dr. Gadjah Mada ülikooli füüsik ja kantsler Bambang Purwanto ning prof. Dr. Sri sultan Hamengkubuwono X, DIY bioloog ja kuberner.