Pendidikan Sains di Indonesia bermula pada zaman Kolonial Belanda pada abad ke -19.
Pada tahun 2021, Indonesia dimasukkan ke dalam lima negara teratas dengan jumlah penerbitan saintifik tertinggi di Asia Tenggara.
Pada tahun 2020, Indonesia menduduki tempat ke -62 di dunia dari segi kualiti pendidikan sains mengikut kedudukan QS World University.
Salah satu program pendidikan sains popular di Indonesia ialah Olimpik Sains Kebangsaan (OSN), yang diadakan setiap tahun untuk pelajar sekolah menengah.
Indonesia juga mempunyai beberapa universiti yang terkenal yang menawarkan program pengajian sains, seperti Institut Teknologi Bandung (ITB) dan Gadjah Mada University (UGM).
Sejak tahun 2013, Indonesia telah menggunakan kurikulum 2013 yang menekankan lebih banyak pembelajaran interaktif dan aplikasi.
Indonesia juga aktif dalam penyelidikan dan pembangunan sains, terutamanya dalam pertanian, teknologi maklumat, dan tenaga boleh diperbaharui.
Pendidikan Sains di Indonesia juga termasuk pelajaran tentang alam sekitar dan pemuliharaan alam.
Indonesia mempunyai beberapa muzium sains yang menarik, seperti Muzium Geologi Bandung dan Muzium Zoolology Bogor.
Beberapa tokoh sains terkenal dari Indonesia termasuk Prof. Dr. Bambang Purwanto, ahli fizik dan canselor Gadjah Mada University, dan Prof. Dr. Sri Sultan Hamengkubuwono X, ahli biologi dan gabenor DIY.
