Zinātnes izglītība Indonēzijā sākās Nīderlandes koloniālajā periodā 19. gadsimtā.
2021. gadā Indonēzija tika iekļauta piecās labākajās valstīs ar vislielāko zinātnisko publikāciju skaitu Dienvidaustrumu Āzijā.
2020. gadā Indonēzija pasaulē ieņēma 62. vietu zinātnes izglītības kvalitātes ziņā saskaņā ar QS World University rangu.
Viena no populārās zinātnes izglītības programmām Indonēzijā ir Nacionālā zinātnes olimpiāde (OSN), kas katru gadu notiek vidusskolēniem.
Indonēzijā ir arī vairākas labi zināmas universitātes, kas piedāvā zinātnes studiju programmas, piemēram, Bandungas Tehnoloģiju institūtu (ITB) un Gadjah Mada universitāti (UGM).
Kopš 2013. gada Indonēzija ir pieņēmusi 2013. gada mācību programmu, kas uzsver interaktīvāku un piemērotāku mācīšanos.
Indonēzija aktīvi darbojas arī zinātnes izpētē un attīstībā, īpaši lauksaimniecībā, informācijas tehnoloģijās un atjaunojamajā enerģijā.
Zinātnes izglītība Indonēzijā ietver arī mācības par vidi un dabas saglabāšanu.
Indonēzijā ir vairāki interesanti zinātnes muzeji, piemēram, Bandungas ģeoloģijas muzejs un Bogoras zooloģijas muzejs.
Daži slavenie Indonēzijas zinātnes dati ietver prof. Dr. Bambang Purwanto, fiziķis un Gadjah Mada universitātes kanclers un prof. Dr. Šri sultāns Hamengkubuwono X, DIY biologs un gubernators.
