Vedecké vzdelávanie v Indonézii sa začalo v holandskom koloniálnom období v 19. storočí.
V roku 2021 bola Indonézia zaradená do piatich najlepších krajín s najvyšším počtom vedeckých publikácií v juhovýchodnej Ázii.
V roku 2020 sa Indonézia umiestnila na 62. mieste na svete, pokiaľ ide o kvalitu vedeckého vzdelávania podľa rebríčka QS World University.
Jedným z populárnych programov vedeckého vzdelávania v Indonézii je National Science Olympiad (OSN), ktorý sa koná každý rok pre študentov stredných škôl.
Indonézia má tiež niekoľko známych univerzít, ktoré ponúkajú vedecké študijné programy, ako napríklad Bandung Institute of Technology (ITB) a Gadjah Mada University (UGM).
Od roku 2013 Indonézia prijala učebné osnovy v roku 2013, ktoré zdôrazňujú interaktívnejšie a uplatniteľné vzdelávanie.
Indonézia je tiež aktívna vo výskume a rozvoji vedy, najmä v poľnohospodárstve, informačných technológiách a obnoviteľnej energii.
Vedecké vzdelávanie v Indonézii zahŕňa aj lekcie o životnom prostredí a ochrane prírody.
Indonézia má niekoľko zaujímavých vedeckých múzeí, ako napríklad múzeum Geology Bandung Geology a Bogor Zoolology Museum.
Medzi niektoré slávne vedecké postavy z Indonézie patrí prof. DR. Bambang Purwanto, fyzik a kancelárka univerzity Gadjah Mada, a prof. DR. Sri Sultan Hamengkubuwono X, biológ a guvernér DIY.
