Botanika dolazi od grčke riječi botanane što znači biljke.
Drevni Egipćani razvili su tehnike sadnje i održavanja biljaka od 4.000 prije Krista.
Teoriju klijanja sjemena prvi je put predložio grčki filozof u 4. stoljeću prije Krista, Teofrastus.
U 16. stoljeću Carolus Linnaeus razvio je sustav klasifikacije biljaka koji se i danas koristio.
U 18. stoljeću Joseph Banks otputovao je u Australiju i pronašao mnoge nove biljne vrste.
U 19. stoljeću, Gregor Mendel otkrio je princip genetskog nasljeđivanja u svom istraživanju o grafu.
Charles Darwin koristi svoje znanje o botanici za razvoj teorije evolucije.
U 20. stoljeću, Norman Borlaug razvio je sorte pšenice koje su bile otpornije na bolest i ekstremnu klimu, spašavajući stotine milijuna života od gladi.
Ukrasne biljke postale su poznate krajem 19. stoljeća i početkom 20. stoljeća, a mnoge su vrste pronađene i razvijene.
Moderna botanička istraživanja uzrokovala su razvoj novih lijekova, poboljšanja poljoprivrede i istraživanja o klimi i promjenama okoliša.