Botanika izvira iz grške besede botannana, kar pomeni rastline.
Starodavni Egipčani so od 4.000 pred našim štetjem razvili tehnike sajenja in vzdrževanja rastlin.
Teorija kalitve semena je v 4. stoletju predlagal grški filozof, Theophrastus v 4. stoletju pred našim štetjem.
V 16. stoletju je Carolus Linnaeus razvil sistem za klasifikacijo rastlin, ki je bil še danes uporabljen.
V 18. stoletju je Joseph Banks odpotoval v Avstralijo in našel veliko novih rastlinskih vrst.
V 19. stoletju je Gregor Mendel odkril načelo genetske dedovanja v svoji raziskavi graha.
Charles Darwin uporablja svoje znanje o botaniki za razvoj teorije evolucije.
Norman Borlaug je v 20. stoletju razvil pšenične sorte, ki so bile bolj odporne na bolezni in skrajno podnebje, pri čemer je od lakote rešilo sto milijonov življenj.
Okrasne rastline so postale znane ob koncu 19. stoletja in zgodnjega 20. stoletja, pri čemer se je veliko vrst našlo in razvijalo.
Sodobne botanične raziskave so povzročile razvoj novih zdravil, izboljšanja kmetijstva in raziskav o podnebnih in okoljskih spremembah.