Botanika kyla iš graikų kalbos žodžio botanano, kuris reiškia augalus.
Senovės egiptiečiai nuo 4000 m. Pr. Kr. Sukūrė augalų sodinimo ir priežiūros metodus.
Sėklų daigumo teoriją pirmiausia pasiūlė VIII a. Pr. Kr. Graikijos filosofas Teophrastus.
XVI amžiuje Carolus Linnaeus sukūrė augalų klasifikavimo sistemą, kuri vis dar buvo naudojama šiandien.
XVIII amžiuje Josephas Banksas išvyko į Australiją ir rado daug naujų augalų rūšių.
XIX amžiuje Gregoras Mendelis savo tyrimuose apie žirnius atrado genetinio paveldėjimo principą.
Charlesas Darwinas naudojasi savo žiniomis apie botaniką, kad plėtojtų evoliucijos teoriją.
XX amžiuje Normanas Borlaugas sukūrė kviečių veisles, kurios buvo atsparesnės ligoms ir ekstremaliam klimatui, išgelbėjusiems šimtus milijonų gyvybių iš bado.
Dekoratyviniai augalai išgarsėjo XIX amžiaus ir XX amžiaus pradžios pabaigoje, daugybėje rūšių buvo rasta ir išsivysčiusi.
Šiuolaikiniai botanikos tyrimai sukėlė naujų vaistų, žemės ūkio tobulinimo ir klimato bei aplinkos pokyčių tyrimų plėtrą.