İndoneziyada İndoneziyada Javanese Krallığı ənənəsində yaranan saray və ya saray kimi tanınan bir neçə gizli təşkilat var.
İndoneziyadakı məşhur gizli təşkilatlardan biri, 20-ci əsrin əvvəllərində Batavia (indi Cakarta) qurulmuş sərbəstdir.
Hələ qədim inanclarını və adət-ənənələrini qoruyan doğma balinese insanlardan ibarət olan Bali Ağa adlı gizli bir təşkilat da var.
Digər bir gizli təşkilat, 1959-cu ildə Suharto və yeni sifariş hökumətini dəstəkləyən bir siyasi təşkilat kimi fəaliyyət göstərən bir əsərdir.
Məhəmmədiyyə və Nahdlatul ulama kimi İslam təşkilatları da gizli təşkilatlar hesab olunur, çünki onlar yalnız öz üzvləri tərəfindən tanınan ritual və təcrübələri var.
Pesugihan və ya cadu şamanları kimi mistik təcrübələrə aid bir neçə gizli təşkilat var.
İndoneziyadakı bəzi gizli təşkilatlar dünyada oxşar təşkilatlarla əlaqəli sərbəst təşkilatlarla xaricdəki oxşar təşkilatlarla əlaqəsi var.
İndoneziyadakı gizli təşkilatların üzvləri ümumiyyətlə cəmiyyətdə və ya hökumətdə güc və ya təsiri olan insanlardan ibarətdir.
İndoneziyadakı gizli təşkilatlar çox vaxt məxfi və sirli təbiətinə görə hökumət və ya cəmiyyət tərəfindən təhdid hesab olunur.
İndoneziyadakı bəzi gizli təşkilatlar hökumət tərəfindən həll edildi və ya qadağan edildi, çünki qanun pozuntuları və ya milli təhlükəsizliyi təhdid etdilər.
