Existem várias organizações secretas na Indonésia conhecidas como palácio ou palácio, que se originaram na tradição do reino javanês.
Uma das famosas organizações secretas da Indonésia é a Maçonaria, fundada no início do século XX na Batavia (hoje Jacarta).
Há também uma organização secreta chamada Bali Aga, que consiste em pessoas nativas balinesas que ainda mantêm suas crenças e tradições antigas.
Outra organização secreta é um grupo de obras, fundado em 1959 por Suharto e funciona como uma organização política que apóia o governo da Nova Ordem.
Organizações islâmicas como Muhammadiyah e Nahdlatul ulama também são consideradas organizações secretas, porque têm rituais e práticas que são conhecidas apenas por seus próprios membros.
Existem várias organizações secretas relacionadas às práticas místicas, como Pesugihan ou xamãs de bruxaria.
Algumas organizações secretas na Indonésia têm um relacionamento com organizações semelhantes no exterior, como a Maçonaria relacionada a organizações semelhantes em todo o mundo.
Membros de organizações secretas na Indonésia geralmente consistem em pessoas que têm poder ou influência na sociedade ou governo.
As organizações secretas na Indonésia são frequentemente consideradas uma ameaça do governo ou da comunidade por causa de sua natureza confidencial e misteriosa.
Algumas organizações secretas na Indonésia foram dissolvidas ou proibidas pelo governo porque são consideradas violar a lei ou ameaçar a segurança nacional.
