V Indonézii existuje niekoľko tajných organizácií známych ako palác alebo palác, ktoré vznikli v tradícii javánskeho kráľovstva.
Jednou zo slávnych tajných organizácií v Indonézii je slobodomurárstvo, ktoré bolo založené na začiatku 20. storočia v Batavii (teraz Jakarta).
Existuje aj tajná organizácia s názvom Bali Aga, ktorá pozostáva z rodných balijských ľudí, ktorí si stále udržiavajú svoje starodávne presvedčenie a tradície.
Ďalšou tajnou organizáciou je skupina diel, ktorú založil Suharto v roku 1959 a funguje ako politická organizácia, ktorá podporuje vládu nového poriadku.
Islamské organizácie ako Muhammadiyah a Nahdlatul Ulama sa tiež považujú za tajné organizácie, pretože majú rituály a praktiky, ktoré sú známe iba ich vlastnými členmi.
Existuje niekoľko tajných organizácií súvisiacich s mystickými praktikami, ako napríklad Pesugihan alebo Witchcraft Shamans.
Niektoré tajné organizácie v Indonézii majú vzťah s podobnými organizáciami v zahraničí, napríklad slobodomurárstvo súvisiace s podobnými organizáciami na celom svete.
Členovia tajných organizácií v Indonézii sa zvyčajne skladajú z ľudí, ktorí majú moc alebo vplyv na spoločnosť alebo vládu.
Tajné organizácie v Indonézii sa často považujú za hrozbu vlády alebo komunity kvôli svojej dôvernej a tajomnej povahe.
Niektoré tajné organizácie v Indonézii boli vládou rozpustené alebo zakázané, pretože sa považujú za porušenie zákona alebo ohrozujú národnú bezpečnosť.
