Există mai multe organizații secrete în Indonezia, cunoscute sub numele de Palat sau Palat, care au avut originea în tradiția Regatului Javanez.
Una dintre celebrele organizații secrete din Indonezia este Francmasoneria, care a fost fondată la începutul secolului XX în Batavia (acum Jakarta).
Există, de asemenea, o organizație secretă numită Bali Aga, care este formată din oameni balinezi autohtoni care încă își mențin credințele și tradițiile antice.
O altă organizație secretă este un grup de lucrări, care a fost fondată în 1959 de Suharto și funcționează ca organizație politică care susține guvernul de nou ordin.
Organizațiile islamice precum Muhammadiyah și Nahdlatul Ulama sunt, de asemenea, considerate ca organizații secrete, deoarece au ritualuri și practici care sunt cunoscute doar de propriii membri.
Există mai multe organizații secrete legate de practicile mistice, cum ar fi șamanii pesgihan sau vrăjitorie.
Unele organizații secrete din Indonezia au o relație cu organizații similare din străinătate, cum ar fi francmasoneria legată de organizații similare din întreaga lume.
Membrii organizațiilor secrete din Indonezia constau de obicei din persoane care au putere sau influență în societate sau guvern.
Organizațiile secrete din Indonezia sunt adesea considerate o amenințare din partea guvernului sau a comunității din cauza naturii lor confidențiale și misterioase.
Unele organizații secrete din Indonezia au fost dizolvate sau interzise de guvern, deoarece sunt considerate că încalcă legea sau amenință securitatea națională.
