Існує кілька секретних організацій в Індонезії, відомі як Палац чи палац, які виникли в традиції Яванського царства.
Однією з відомих таємних організацій Індонезії є масонство, яке було засновано на початку 20 століття в Батавії (нині Джакарта).
Існує також таємна організація під назвою Bali Aga, яка складається з рідних балійських людей, які досі підтримують свої давні вірування та традиції.
Ще одна таємна організація - це група робіт, яка була заснована в 1959 році Сухарто і функціонує як політична організація, яка підтримує уряд Нового порядку.
Ісламські організації, такі як Мухаммадія та Нахдлатул Улама, також вважаються таємними організаціями, оскільки вони мають ритуали та практики, які відомі лише власні члени.
Існує кілька секретних організацій, пов’язаних з містичними практиками, такими як песугіхан або чаклунські шамани.
Деякі таємні організації в Індонезії мають стосунки з подібними організаціями за кордоном, такими як масонство, пов'язані з подібними організаціями у всьому світі.
Члени таємних організацій в Індонезії зазвичай складаються з людей, які мають владу чи вплив у суспільстві чи уряді.
Таємні організації в Індонезії часто вважаються загрозою уряду чи громади через їх конфіденційну та загадкову природу.
Деякі таємні організації в Індонезії були розпущені або заборонені урядом, оскільки вони вважаються порушенням закону або загрожують національній безпеці.
