У Інданезіі ёсць некалькі сакрэтных арганізацый, вядомых як палац ці палац, якія ўзніклі ў традыцыі Яванскай царства.
Адной з вядомых сакрэтных арганізацый у Інданезіі з'яўляецца масонства, якая была заснавана ў пачатку 20 стагоддзя ў Батавіі (цяпер Джакарта).
Існуе таксама сакрэтная арганізацыя пад назвай Балі Ага, якая складаецца з мясцовых балійскіх людзей, якія ўсё яшчэ захоўваюць свае старажытныя перакананні і традыцыі.
Яшчэ адна сакрэтная арганізацыя - гэта група работ, якая была заснавана ў 1959 годзе Сухарта і функцыянуе як палітычная арганізацыя, якая падтрымлівае ўрад Новага парадку.
Ісламскія арганізацыі, такія як Мухамадыя і Нахдлатул Улама, таксама разглядаюцца як сакрэтныя арганізацыі, паколькі ў іх ёсць рытуалы і практыкі, якія ведаюць толькі ўласныя члены.
Існуе некалькі сакрэтных арганізацый, звязаных з містычнымі практыкамі, такімі як песугіхан або шаманы вядзьмарства.
Некаторыя сакрэтныя арганізацыі ў Інданезіі маюць адносіны з падобнымі арганізацыямі за мяжой, напрыклад, масонства, звязаныя з аналагічнымі арганізацыямі па ўсім свеце.
Члены сакрэтных арганізацый у Інданезіі звычайна складаюцца з людзей, якія маюць уладу ці ўплыў у грамадстве ці ўрадзе.
Сакрэтныя арганізацыі ў Інданезіі часта лічацца пагрозай з боку ўрада ці грамадства з -за іх канфідэнцыйнага і загадкавага характару.
Некаторыя сакрэтныя арганізацыі ў Інданезіі былі распушчаны альбо забаронены ўрадам, паколькі яны лічацца парушэннем закона альбо пагражаюць нацыянальнай бяспецы.