Ensimmäinen juna Indonesiassa vihittiin käyttöön vuonna 1867 ja sitä käytettiin Semarangin ja Yogyakartan välillä.
Indonesian pisin juna on Argo Bromo Anggrek -juna, joka toimii Jakartan ja Surabayan välillä noin 800 km: n etäisyydellä.
Siellä on turistijuna, joka tarjoaa matkaa Indonesian ympärillä, kuten Gajah Wongin matkailujuna ja Semarangin matkailujuna.
Indonesian nopein matkustajajuna on Argo Dwipangga Pikajuna, jonka nopeus on 160 km/tunnissa.
On erityisiä tavaroita, joissa on ruoka -ainesosia, kuten riisilogistiikkajunia ja liha -logistiikkajunia.
Indonesian junilla on luokkajärjestelmä, kuten talous-, yritys- ja toimeenpanokurssit.
On junia, joissa on ylellisiä tiloja, kuten sängyt, kylpyhuoneet ja ravintolat, kuten ylelliset Indonesia -junat.
On junia, joilla on turistireiti, kuten Jakartan ja Bogorin välillä toimiva Pangrango -matkailujuna.
On olemassa junia, jotka on koristeltu Indonesian taiteilla ja kulttuurilla, kuten soolo -päävesujuna, jossa on sisustus, joka on täynnä perinteisiä javanilaisia taidetta.