Indonesië het baie belangrike fossielplekke, soos die Sangiran -terrein en Trinil -terrein in Oos -Java, wat 'n ou menslike fossielterrein is.
Die bevindinge van die eerste dinosourusfossiel in Indonesië was in die 1920's in die Cikakak -streek, Wes -Java.
Een van die beroemdste dinosourusfossiele uit Indonesië is Bawangosaurus, wat in die Sula -eilande, Maluku, aangetref is.
In 2016 het 'n navorsingspan 'n dinosourus -voetspoor gevind wat ongeveer 145 miljoen jaar op Java was.
Antieke visfossiele wat in Indonesië voorkom, sluit in buntale visse en antieke haaie.
Sommige fossielterreine in Indonesië het UNESCO -wêrelderfenisgebiede geword, insluitend die Sangiran -terrein en die Gunung Padang -terrein in Wes -Java.
Die oudste perdefossiele ter wêreld word in Indonesië aangetref en word na raming ongeveer 1,5 miljoen jaar oud.
Daar is verskillende soorte prehistoriese soogdiere wat in Indonesië voorkom, waaronder prehistoriese varke en antieke olifante.
Onlangse navorsing toon dat antieke mense in Indonesië moontlik vroeër na Australië gemigreer het as wat voorheen gedink is.
Daar is baie universiteite en institute in Indonesië wat navorsingsprogramme en fasiliteite op die gebied van paleontologie het, insluitend die Gadjah Mada -universiteit in Yogyakarta en Bandung Institute of Technology.
