इंडोनेशिया में कई महत्वपूर्ण जीवाश्म साइटें हैं, जैसे कि पूर्वी जावा में सांगिरन साइट और ट्रिनिल साइट, जो एक प्राचीन मानव जीवाश्म साइट है।
इंडोनेशिया में पहले डायनासोर जीवाश्म के निष्कर्ष 1920 के दशक में CIKAKAK क्षेत्र, पश्चिम जावा में थे।
इंडोनेशिया के सबसे प्रसिद्ध डायनासोर जीवाश्मों में से एक बावंगोसॉरस है, जो सुला द्वीप समूह, मलुकु में पाया गया था।
2016 में, एक शोध टीम ने एक डायनासोर पदचिह्न पाया जो जावा पर लगभग 145 मिलियन साल पुराना था।
इंडोनेशिया में पाए जाने वाले प्राचीन मछली के जीवाश्मों में बंटल मछली और प्राचीन शार्क शामिल हैं।
इंडोनेशिया में कुछ जीवाश्म स्थल पश्चिम जावा में सांगिरन साइट और गुनंग पडांग साइट सहित यूनेस्को विश्व विरासत स्थल बन गए हैं।
दुनिया के सबसे पुराने घोड़े के जीवाश्म इंडोनेशिया में पाए जाते हैं और लगभग 1.5 मिलियन वर्ष पुराने होने का अनुमान है।
इंडोनेशिया में प्रागैतिहासिक स्तनधारियों की कई प्रजातियां हैं, जिनमें प्रागैतिहासिक सूअर और प्राचीन हाथी शामिल हैं।
हाल के शोध से पता चलता है कि इंडोनेशिया में प्राचीन मनुष्य पहले से सोचा से पहले ऑस्ट्रेलिया चले गए होंगे।
इंडोनेशिया में कई विश्वविद्यालय और संस्थान हैं, जिनमें पेलियोन्टोलॉजी के क्षेत्र में अनुसंधान कार्यक्रम और सुविधाएं हैं, जिनमें योग्याकार्टा में गडजाह मडा विश्वविद्यालय और प्रौद्योगिकी संस्थान शामिल हैं।
