Indonesia har mange viktige fossile steder, for eksempel Sangiran -stedet og Trinil -stedet i East Java, som er et gammelt menneskelig fossilsted.
Funnene av den første dinosaurfossilen i Indonesia var på 1920 -tallet i Cikakak -regionen, West Java.
En av de mest kjente dinosaurfossilene fra Indonesia er Bawangosaurus, som ble funnet på Sula Islands, Maluku.
I 2016 fant et forskerteam et dinosaur -fotavtrykk som var rundt 145 millioner år gammelt på Java.
Gamle fiskefossiler som finnes i Indonesia inkluderer Buntal Fish og gamle haier.
Noen fossile steder i Indonesia har blitt UNESCOs verdensarvsteder, inkludert Sangiran -stedet og Gunung Padang -stedet i West Java.
De eldste hestefossilene i verden finnes i Indonesia og anslås å være rundt 1,5 millioner år gammel.
Det er flere arter av forhistoriske pattedyr som finnes i Indonesia, inkludert forhistoriske griser og gamle elefanter.
Nyere forskning viser at gamle mennesker i Indonesia kan ha migrert til Australia tidligere enn tidligere antatt.
Det er mange universiteter og institutter i Indonesia som har forskningsprogrammer og fasiliteter innen paleontologi, inkludert Gadjah Mada University i Yogyakarta og Bandung Institute of Technology.
