Die eerste genetiese kenner van Indonesië is prof. Dr. Koentjaraningrat, bekend as die vader van die Indonesiese sosiologie.
Genetiese navorsing in Indonesië het in 1928 deur Dr. J.C. Koningsberger, 'n Nederlandse botanis.
Genetiese navorsing in Indonesië het vinnig in die 1950's en 1960's ontwikkel met die ontdekking van die eerste menslike chromosoom in Indonesië deur prof. Dr. S. Sudjadi.
Die ontwikkeling van DNA -vingerafdruk -tegnologie in Indonesië is voorafgegaan deur prof. Dr. Widodo Judarwanto in die negentigerjare.
In 2007 slaag Indonesië daarin om DNA by die hele Indonesiese bevolking deur die Nusantara Genome -projek te versamel.
Genetiese studies by Indonesiese diere toon dat die teenwoordigheid van endemiese spesies slegs in Indonesië voorkom, soos Javaanse tiere en Sumatran -orangoetangs.
Sommige genetiese studies in Indonesië hou ook verband met gesondheid, soos die studie van genetiese faktore wat die risiko van diabetes en borskanker beïnvloed.
Indonesië het ryk genetiese hulpbronne, soos tradisionele medisinale plante, wat gebruik kan word vir die ontwikkeling van nuwe medisyne.
Sommige genetiese studies in Indonesië toon ook genetiese verskille tussen verskillende etniese groepe in Indonesië.
Tans het Indonesië 'n aantal vooraanstaande genetiese kundiges ter wêreld, soos prof. Dr. Herawati Sudoyo, wat baie bygedra het tot genetiese navorsing in Indonesië.