Pirmasis Indonezijos genetinis ekspertas yra prof. Dr. Koentjaraningrat, žinomas kaip Indonezijos sociologijos tėvas.
Genetiniai tyrimai Indonezijoje 1928 m. Pradėjo Dr. J.C. Koningsbergeris, olandų botanikas.
Genetiniai tyrimai Indonezijoje greitai išsivystė šeštajame ir septintajame dešimtmečiuose, atradus pirmąją žmogaus chromosomą Indonezijoje, prof. Dr. S. Sudjadi.
Prieš DNR pirštų atspaudų technologijos plėtrą Indonezijoje buvo prof. Dr. Dešimtajame dešimtmetyje Widodo Judarwanto.
2007 m. Indonezijai pavyko surinkti DNR iš visos Indonezijos gyventojų per „Nusantara“ genomo projektą.
Indonezijos gyvūnų genetiniai tyrimai rodo, kad endeminių rūšių buvimas randamas tik Indonezijoje, tokiuose kaip Javanese tigrai ir Sumatrano orangutanai.
Kai kurie genetiniai tyrimai Indonezijoje taip pat yra susiję su sveikata, pavyzdžiui, genetinių veiksnių, turinčių įtakos diabeto ir krūties vėžio rizikai, tyrimas.
Indonezija turi turtingus genetinius išteklius, tokius kaip tradiciniai vaistiniai augalai, kurie gali būti naudojami kuriant naujus vaistus.
Kai kurie genetiniai tyrimai Indonezijoje taip pat rodo genetinius skirtumus tarp skirtingų etninių grupių Indonezijoje.
Šiuo metu Indonezijoje yra keletas pirmaujančių genetinių ekspertų pasaulyje, tokių kaip prof. Dr. Harawati Sudoyo, kuris daug prisidėjo prie genetinių tyrimų Indonezijoje.