Indonesiens første genetiske ekspert er prof. Dr. Koentjaraningrat, kendt som far til den indonesiske sociologi.
Genetisk forskning i Indonesien begyndte i 1928 af Dr. J.C. Koningsberger, en hollandsk botaniker.
Genetisk forskning i Indonesien udviklede sig hurtigt i 1950'erne og 1960'erne med opdagelsen af det første humane kromosom i Indonesien af prof. Dr. S. Sudjadi.
Udviklingen af DNA -fingeraftryksteknologi i Indonesien blev forudgående af prof. Dr. Widodo Judarwanto i 1990'erne.
I 2007 lykkedes det Indonesien at indsamle DNA fra hele den indonesiske befolkning gennem Nusantara Genome -projektet.
Genetiske undersøgelser i indonesiske dyr viser, at tilstedeværelsen af endemiske arter kun findes i Indonesien, såsom javanske tigre og Sumatran -orangutans.
Nogle genetiske undersøgelser i Indonesien er også relateret til sundhed, såsom undersøgelse af genetiske faktorer, der påvirker risikoen for at udvikle diabetes og brystkræft.
Indonesien har rige genetiske ressourcer, såsom traditionelle medicinske planter, som kan bruges til udvikling af nye lægemidler.
Nogle genetiske undersøgelser i Indonesien viser også genetiske forskelle mellem forskellige etniske grupper i Indonesien.
I øjeblikket har Indonesien en række førende genetiske eksperter i verden, såsom prof. Dr. Herawati Sudoyo, der har bidraget meget til genetisk forskning i Indonesien.