Pakar genetik pertama Indonesia adalah Prof. Dr. Koentjaraningrat, yang dikenali sebagai bapa sosiologi Indonesia.
Penyelidikan Genetik di Indonesia bermula pada tahun 1928 oleh Dr. J.C. Koningsberger, seorang ahli botani Belanda.
Penyelidikan genetik di Indonesia berkembang pesat pada tahun 1950 -an dan 1960 -an dengan penemuan kromosom manusia pertama di Indonesia oleh Prof. Dr. S. Sudjadi.
Pembangunan teknologi cap jari DNA di Indonesia didahului oleh Prof. Dr. Widodo Judarwanto pada tahun 1990 -an.
Pada tahun 2007, Indonesia berjaya mengumpul DNA dari seluruh penduduk Indonesia melalui Projek Genom Nusantara.
Kajian genetik di haiwan Indonesia menunjukkan bahawa kehadiran spesies endemik hanya terdapat di Indonesia, seperti harimau Jawa dan orang utan sumatran.
Beberapa kajian genetik di Indonesia juga berkaitan dengan kesihatan, seperti kajian faktor genetik yang mempengaruhi risiko membangunkan diabetes dan kanser payudara.
Indonesia mempunyai sumber genetik yang kaya, seperti tumbuhan perubatan tradisional, yang boleh digunakan untuk pembangunan ubat -ubatan baru.
Beberapa kajian genetik di Indonesia juga menunjukkan perbezaan genetik antara kumpulan etnik yang berlainan di Indonesia.
Pada masa ini, Indonesia mempunyai beberapa pakar genetik terkemuka di dunia, seperti Prof. Dr. Herawati Sudoyo, yang telah banyak menyumbang kepada penyelidikan genetik di Indonesia.
