Prvním genetickým odborníkem Indonésie je Prof. Dr. Koentjaraningrat, známý jako otec indonéské sociologie.
Genetický výzkum v Indonésii zahájil v roce 1928 Dr. J.C. Koningsberger, nizozemský botanik.
Genetický výzkum v Indonésii se rychle vyvinul v 50. a 60. letech s objevem prvního lidského chromozomu v Indonésii od prof. Dr. S. Sudjadi.
Vývoj technologie otisků prstů DNA v Indonésii předcházel Prof. Dr. Widodo Jurwanto v 90. letech.
V roce 2007 se Indonésii podařilo shromažďovat DNA z celé indonéské populace prostřednictvím projektu Nusantara Genome.
Genetické studie u indonéských zvířat ukazují, že přítomnost endemických druhů se vyskytuje pouze v Indonésii, jako jsou Javanese tygři a sumatran orangutany.
Některé genetické studie v Indonésii souvisejí také se zdravím, jako je studium genetických faktorů, které ovlivňují riziko rozvoje diabetu a rakoviny prsu.
Indonésie má bohaté genetické zdroje, jako jsou tradiční léčivé rostliny, které lze použít pro rozvoj nových léků.
Některé genetické studie v Indonésii také ukazují genetické rozdíly mezi různými etnickými skupinami v Indonésii.
V současné době má Indonésie řadu předních genetických odborníků na světě, jako je prof. Dr. Herawati Sudoyo, který hodně přispěl k genetickému výzkumu v Indonésii.
