De eerste genetische expert van Indonesië is prof. Dr. Koentjaraningrat, bekend als de vader van de Indonesische sociologie.
Genetisch onderzoek in Indonesië begon in 1928 door Dr. J.C. Koningsberger, een Nederlandse botanicus.
Genetisch onderzoek in Indonesië ontwikkelde zich snel in de jaren 1950 en 1960 met de ontdekking van het eerste menselijke chromosoom in Indonesië door Prof. Dr. S. Sudjadi.
De ontwikkeling van DNA -vingerafdruktechnologie in Indonesië werd voorafgegaan door Prof. Dr. Widodo Judarwanto in de jaren negentig.
In 2007 slaagde Indonesië erin DNA te verzamelen van de gehele Indonesische bevolking via het Nusantara Genome Project.
Genetische studies bij Indonesische dieren laten zien dat de aanwezigheid van endemische soorten alleen wordt gevonden in Indonesië, zoals Javaanse tijgers en Sumatraanse orang -oetans.
Sommige genetische studies in Indonesië zijn ook gerelateerd aan de gezondheid, zoals de studie van genetische factoren die het risico op het ontwikkelen van diabetes en borstkanker beïnvloeden.
Indonesië heeft rijke genetische bronnen, zoals traditionele medicinale planten, die kunnen worden gebruikt voor de ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen.
Sommige genetische studies in Indonesië vertonen ook genetische verschillen tussen verschillende etnische groepen in Indonesië.
Momenteel heeft Indonesië een aantal toonaangevende genetische experts ter wereld, zoals Prof. Dr. Herawati Sudoyo, die veel heeft bijgedragen aan genetisch onderzoek in Indonesië.
