Chuyên gia di truyền đầu tiên của Indonesia là Giáo sư. Chất cấp. Koentjaraningrat, được gọi là cha đẻ của xã hội học Indonesia.
Nghiên cứu di truyền ở Indonesia bắt đầu vào năm 1928 bởi Dr. J.C. Koningsberger, một nhà thực vật học Hà Lan.
Nghiên cứu di truyền ở Indonesia đã phát triển nhanh chóng vào những năm 1950 và 1960 với việc phát hiện ra nhiễm sắc thể người đầu tiên ở Indonesia bởi Giáo sư. Chất cấp. S. Sudjadi.
Sự phát triển của công nghệ dấu vân tay DNA ở Indonesia được đi trước bởi Giáo sư. Chất cấp. Widodo Judarwanto vào những năm 1990.
Năm 2007, Indonesia đã thành công trong việc thu thập DNA từ toàn bộ dân số Indonesia thông qua dự án bộ gen của Nusantara.
Các nghiên cứu di truyền ở động vật Indonesia cho thấy sự hiện diện của các loài đặc hữu chỉ được tìm thấy ở Indonesia, chẳng hạn như hổ Java và đười ươi Sumatran.
Một số nghiên cứu di truyền ở Indonesia cũng liên quan đến sức khỏe, chẳng hạn như nghiên cứu các yếu tố di truyền ảnh hưởng đến nguy cơ mắc bệnh tiểu đường và ung thư vú.
Indonesia có tài nguyên di truyền phong phú, chẳng hạn như cây thuốc truyền thống, có thể được sử dụng để phát triển các loại thuốc mới.
Một số nghiên cứu di truyền ở Indonesia cũng cho thấy sự khác biệt di truyền giữa các nhóm dân tộc khác nhau ở Indonesia.
Hiện tại, Indonesia có một số chuyên gia di truyền hàng đầu trên thế giới, chẳng hạn như Giáo sư. Chất cấp. Herawati Sudoyo, người đã đóng góp rất nhiều cho nghiên cứu di truyền ở Indonesia.
