Pierwszym ekspertem genetycznym w Indonezji jest prof. Dr. Koentjaraningrat, znany jako ojciec indonezyjskiej socjologii.
Badania genetyczne w Indonezji rozpoczęły się w 1928 r. Przez dr Dr. J.C. Koningsberger, holenderski botanik.
Badania genetyczne w Indonezji rozwinęły się szybko w latach 50. i 60. XX wieku wraz z odkryciem pierwszego ludzkiego chromosomu w Indonezji przez Prof. Dr. S. Sudjadi.
Rozwój technologii odcisków palców DNA w Indonezji był poprzedzony przez prof. Dr. Widodo Judarwanto w latach 90.
W 2007 r. Indonezji udało się zebrać DNA z całej populacji indonezyjskiej poprzez projekt genomu Nusantara.
Badania genetyczne na zwierząt indonezyjskich pokazują, że obecność gatunków endemicznych występuje tylko w Indonezji, takich jak tygrysy jawajskie i sumatranowe orangutany.
Niektóre badania genetyczne w Indonezji są również związane ze zdrowiem, takie jak badanie czynników genetycznych, które wpływają na ryzyko rozwoju cukrzycy i raka piersi.
Indonezja ma bogate zasoby genetyczne, takie jak tradycyjne rośliny lecznicze, które mogą być stosowane do rozwoju nowych leków.
Niektóre badania genetyczne w Indonezji wykazują również różnice genetyczne między różnymi grupami etnicznymi w Indonezji.
Obecnie Indonezja ma wielu wiodących ekspertów genetycznych na świecie, takich jak prof. Dr. Herawati Sudoyo, który wiele przyczynił się do badań genetycznych w Indonezji.
