Indonesias første genetiske ekspert er prof. Dr. Koentjaraningrat, kjent som faren til indonesisk sosiologi.
Genetisk forskning i Indonesia begynte i 1928 av Dr. J.C. Koningsberger, en nederlandsk botaniker.
Genetisk forskning i Indonesia utviklet seg raskt på 1950- og 1960 -tallet med oppdagelsen av det første menneskelige kromosomet i Indonesia av prof. Dr. S. Sudjadi.
Utviklingen av DNA -fingeravtrykksteknologi i Indonesia ble gitt av prof. Dr. Widodo Judarwanto på 1990 -tallet.
I 2007 lyktes Indonesia med å samle DNA fra hele den indonesiske befolkningen gjennom Nusantara Genome Project.
Genetiske studier på indonesiske dyr viser at tilstedeværelsen av endemiske arter bare finnes i Indonesia, for eksempel javanske tigre og Sumatran orangutanger.
Noen genetiske studier i Indonesia er også relatert til helse, for eksempel studiet av genetiske faktorer som påvirker risikoen for å utvikle diabetes og brystkreft.
Indonesia har rike genetiske ressurser, for eksempel tradisjonelle medisinplanter, som kan brukes til utvikling av nye medisiner.
Noen genetiske studier i Indonesia viser også genetiske forskjeller mellom forskjellige etniske grupper i Indonesia.
For tiden har Indonesia en rekke ledende genetiske eksperter i verden, som prof. Dr. Herawati Sudoyo, som har bidratt mye til genetisk forskning i Indonesia.