Il primo esperto genetico dell'Indonesia è Prof. Dottore Koentjaraningrat, noto come padre della sociologia indonesiana.
La ricerca genetica in Indonesia è iniziata nel 1928 dal Dr. J.C. Koningsberger, un botanico olandese.
La ricerca genetica in Indonesia si è sviluppata rapidamente negli anni '50 e '60 con la scoperta del primo cromosoma umano in Indonesia da parte del Prof. Dottore S. Sudjadi.
Lo sviluppo della tecnologia delle impronte digitali del DNA in Indonesia è stato preceduto dal Prof. Dottore Widodo Judarwanto negli anni '90.
Nel 2007, l'Indonesia è riuscita a raccogliere il DNA dall'intera popolazione indonesiana attraverso il progetto del genoma di Nusantara.
Studi genetici negli animali indonesiani mostrano che la presenza di specie endemiche si trova solo in Indonesia, come le tigri giavanesi e gli oranghi di Sumatra.
Alcuni studi genetici in Indonesia sono anche correlati alla salute, come lo studio di fattori genetici che influenzano il rischio di sviluppare diabete e carcinoma mammario.
L'Indonesia ha risorse genetiche ricche, come le piante medicinali tradizionali, che possono essere utilizzate per lo sviluppo di nuovi farmaci.
Alcuni studi genetici in Indonesia mostrano anche differenze genetiche tra diversi gruppi etnici in Indonesia.
Al momento, l'Indonesia ha una serie di importanti esperti genetici nel mondo, come la Prof. Dottore Herawati Sudoyo, che ha contribuito molto alla ricerca genetica in Indonesia.
