Prvi genetski strokovnjak Indonezije je prof. Doktor Koentnjaraningrat, znan kot oče indonezijske sociologije.
Genetske raziskave v Indoneziji so začele leta 1928 Dr. J.C. Koningsberger, nizozemski botanik.
Genetske raziskave v Indoneziji so se hitro razvile v petdesetih in šestdesetih letih prejšnjega stoletja z odkritjem prvega človeškega kromosoma v Indoneziji s strani prof. Doktor S. Sudjadi.
Razvoj tehnologije prstnih odtisov DNK v Indoneziji je pred prof. Doktor Widodo Judarwanto v devetdesetih letih prejšnjega stoletja.
Leta 2007 je Indoneziji uspelo zbrati DNK iz celotne indonezijske populacije s pomočjo projekta genoma Nusantara.
Genetske študije pri indonezijskih živalih kažejo, da prisotnost endemičnih vrst najdemo le v Indoneziji, kot sta javanski tigri in sumatranski orangutani.
Nekatere genetske študije v Indoneziji so povezane tudi z zdravjem, kot je študija genetskih dejavnikov, ki vplivajo na tveganje za razvoj sladkorne bolezni in raka dojke.
Indonezija ima bogate genetske vire, kot so tradicionalne zdravilne rastline, ki jih je mogoče uporabiti za razvoj novih zdravil.
Nekatere genetske študije v Indoneziji kažejo tudi genetske razlike med različnimi etničnimi skupinami v Indoneziji.
Trenutno ima Indonezija številne vodilne genetske strokovnjake na svetu, kot je prof. Doktor Herawati Sudoyo, ki je veliko prispeval k genetskim raziskavam v Indoneziji.
