Le premier expert génétique de l'Indonésie est le professeur. Docteur Koentjaraningrat, connu comme le père de la sociologie indonésienne.
La recherche génétique en Indonésie a commencé en 1928 par le Dr J.C. Koningsberger, un botaniste néerlandais.
La recherche génétique en Indonésie s'est développée rapidement dans les années 1950 et 1960 avec la découverte du premier chromosome humain en Indonésie par le professeur. Docteur S. Sudjadi.
Le développement de la technologie des empreintes digitales ADN en Indonésie a été précédée par le professeur. Docteur Widodo Judarwanto dans les années 1990.
En 2007, l'Indonésie a réussi à collecter l'ADN de l'ensemble de la population indonésienne dans le projet du génome de Nusantara.
Les études génétiques chez les animaux indonésiens montrent que la présence d'espèces endémiques ne se trouve qu'en Indonésie, comme les tigres javanais et les orangs-outans de Sumatra.
Certaines études génétiques en Indonésie sont également liées à la santé, telles que l'étude des facteurs génétiques qui affectent le risque de développer le diabète et le cancer du sein.
L'Indonésie possède de riches ressources génétiques, telles que les plantes médicinales traditionnelles, qui peuvent être utilisées pour le développement de nouveaux médicaments.
Certaines études génétiques en Indonésie montrent également des différences génétiques entre différents groupes ethniques en Indonésie.
À l'heure actuelle, l'Indonésie compte un certain nombre d'experts génétiques de premier plan dans le monde, comme le professeur. Docteur Herawati Sudoyo, qui a beaucoup contribué à la recherche génétique en Indonésie.
