Першим генетичним експертом Індонезії є проф. Доктор. Koentjaraningrat, відомий як батько індонезійської соціології.
Генетичні дослідження в Індонезії розпочалися в 1928 році доктором J.C. Koningsberger, голландський ботанік.
Генетичні дослідження в Індонезії швидко розвивалися в 1950 -х та 1960 -х роках з виявленням першої людської хромосоми в Індонезії професором. Доктор. S. Sudjadi.
Розробку технології відбитків ДНК в Індонезії передував професор. Доктор. Відодо Джударванто в 90 -х роках.
У 2007 році Індонезії вдалося збирати ДНК від усього індонезійського населення через проект геному Нусантара.
Генетичні дослідження на індонезійських тваринах показують, що наявність ендемічних видів виявляється лише в Індонезії, таких як яванські тигри та суматранські орангутани.
Деякі генетичні дослідження в Індонезії також пов'язані зі здоров’ям, такими як дослідження генетичних факторів, які впливають на ризик розвитку діабету та раку молочної залози.
Індонезія має багаті генетичні ресурси, такі як традиційні лікарські рослини, які можуть бути використані для розробки нових препаратів.
Деякі генетичні дослідження в Індонезії також показують генетичні відмінності між різними етнічними групами в Індонезії.
В даний час в Індонезії є ряд провідних генетичних експертів у світі, таких як проф. Доктор. Herawati Sudoyo, який багато сприяв генетичним дослідженням в Індонезії.