Indonēzijas pirmais ģenētiskais eksperts ir prof. Dr. Koentjaraningrat, pazīstams kā Indonēzijas socioloģijas tēvs.
Ģenētiskais pētījums Indonēzijā 1928. gadā sāka Dr. J.C. Koningsbergers, holandiešu botāniķis.
Ģenētiskie pētījumi Indonēzijā strauji attīstījās pagājušā gadsimta piecdesmitajos un sešdesmitajos gados, atklājot Pirmo cilvēka hromosomu Indonēzijā, ko veica prof. Dr. S. Sudjadi.
DNS pirkstu noņemšanas tehnoloģijas attīstībai Indonēzijā bija prof. Dr. Widodo Judarwanto 1990. gados.
2007. gadā Indonēzijai izdevās savākt DNS no visas Indonēzijas populācijas caur Nusantara genoma projektu.
Indonēzijas dzīvnieku ģenētiskie pētījumi parāda, ka endēmisko sugu klātbūtne ir atrodama tikai Indonēzijā, piemēram, Javanese tīģeri un Sumatran orangutāni.
Daži ģenētiski pētījumi Indonēzijā ir saistīti arī ar veselību, piemēram, ģenētisko faktoru izpēte, kas ietekmē diabēta un krūts vēža attīstības risku.
Indonēzijai ir bagātīgi ģenētiski resursi, piemēram, tradicionālie ārstniecības augi, kurus var izmantot jaunu zāļu izstrādei.
Daži ģenētiski pētījumi Indonēzijā parāda arī ģenētiskās atšķirības starp dažādām etniskajām grupām Indonēzijā.
Pašlaik Indonēzijā ir vairāki vadošie ģenētiskie eksperti pasaulē, piemēram, prof. Dr. Harawati Sudoyo, kurš ir daudz ieguldījis ģenētiskos pētījumos Indonēzijā.
