Arbenigwr genetig cyntaf Indonesia yw'r Athro. Dr. Koentjaraningrat, a elwir yn dad Cymdeithaseg Indonesia.
Dechreuodd ymchwil enetig yn Indonesia ym 1928 gan Dr. J.C. Koningsberger, botanegydd o'r Iseldiroedd.
Datblygodd ymchwil genetig yn Indonesia yn gyflym yn y 1950au a'r 1960au gyda darganfod y cromosom dynol cyntaf yn Indonesia gan yr Athro. Dr. S. Sudjadi.
Rhagflaenwyd datblygu technoleg olion bysedd DNA yn Indonesia gan yr Athro. Dr. Widodo Judarwanto yn y 1990au.
Yn 2007, llwyddodd Indonesia i gasglu DNA o holl boblogaeth Indonesia trwy Brosiect Genom Nusantara.
Mae astudiaethau genetig mewn anifeiliaid Indonesia yn dangos bod presenoldeb rhywogaethau endemig i'w cael yn Indonesia yn unig, megis teigrod Jafanaidd ac orangutans Sumatran.
Mae rhai astudiaethau genetig yn Indonesia hefyd yn gysylltiedig ag iechyd, megis astudio ffactorau genetig sy'n effeithio ar y risg o ddatblygu diabetes a chanser y fron.
Mae gan Indonesia adnoddau genetig cyfoethog, fel planhigion meddyginiaethol traddodiadol, y gellir eu defnyddio ar gyfer datblygu cyffuriau newydd.
Mae rhai astudiaethau genetig yn Indonesia hefyd yn dangos gwahaniaethau genetig rhwng gwahanol grwpiau ethnig yn Indonesia.
Ar hyn o bryd, mae gan Indonesia nifer o arbenigwyr genetig blaenllaw yn y byd, fel yr Athro. Dr. Herawati Sudoyo, sydd wedi cyfrannu llawer at ymchwil genetig yn Indonesia.
