Първият генетичен експерт в Индонезия е проф. Д -р Koentjaraningrat, известен като бащата на индонезийската социология.
Генетичните изследвания в Индонезия започват през 1928 г. от Dr. J.C. Koningsberger, холандски ботаник.
Генетичните изследвания в Индонезия се развиват бързо през 50 -те и 60 -те години на миналия век с откриването на първата човешка хромозома в Индонезия от проф. Д -р S. Sudjadi.
Развитието на технологията за отпечатъци на ДНК в Индонезия беше предшествано от проф. Д -р Widodo Judarwanto през 90 -те години.
През 2007 г. Индонезия успява да събира ДНК от цялото население на Индонезия чрез проекта за геном на Nusantara.
Генетичните изследвания при индонезийски животни показват, че наличието на ендемични видове се среща само в Индонезия, като явански тигри и суматрански орангутани.
Някои генетични изследвания в Индонезия също са свързани със здравето, като например изследването на генетичните фактори, които влияят на риска от развитие на диабет и рак на гърдата.
Индонезия има богати генетични ресурси, като традиционните лечебни растения, които могат да се използват за развитието на нови лекарства.
Някои генетични изследвания в Индонезия също показват генетични разлики между различни етнически групи в Индонезия.
В момента Индонезия има редица водещи генетични експерти в света, като проф. Д -р Herawati Sudoyo, който допринесе много за генетичните изследвания в Индонезия.