Prvým genetickým odborníkom Indonézie je Prof. DR. Koentjaraningrat, známy ako otec indonézskej sociológie.
Genetický výskum v Indonézii začal v roku 1928 Dr. J.C. Koningsberger, holandský botanik.
Genetický výskum v Indonézii sa rýchlo vyvinul v 50. a 60. rokoch 20. storočia objavením prvého ľudského chromozómu v Indonézii prof. DR. S. Sudjadi.
Vývoj technológie odtlačkov prstov DNA v Indonézii predchádzal prof. DR. Widodo Judarwanto v 90. rokoch 20. storočia.
V roku 2007 sa Indonézii podarilo zbierať DNA z celej indonézskej populácie prostredníctvom projektu Nusantara Genome.
Genetické štúdie na indonézskych zvieratách ukazujú, že prítomnosť endemických druhov sa nachádza iba v Indonézii, ako sú Javanské tigre a Sumatran Orangutans.
Niektoré genetické štúdie v Indonézii sú tiež príbuzné so zdravím, ako je štúdium genetických faktorov, ktoré ovplyvňujú riziko vzniku cukrovky a rakoviny prsníka.
Indonézia má bohaté genetické zdroje, ako sú tradičné liečivé rastliny, ktoré sa môžu použiť na vývoj nových liekov.
Niektoré genetické štúdie v Indonézii tiež ukazujú genetické rozdiely medzi rôznymi etnickými skupinami v Indonézii.
V súčasnosti má Indonézia niekoľko popredných genetických odborníkov na svete, napríklad Prof. DR. Herawati Sudoyo, ktorý veľa prispel k genetickému výskumu v Indonézii.
